Nella seconda sessione di prove libere a Motegi continua il testa a testa tra Jorge Lorenzo e Dani Pedrosa, anche se questa volta ad avere la meglio è stato il pilota del team Repsol grazie al suo giro più veloce ottenuto in 1'46"088 (quasi mezzo secondo più veloce rispetto al turno precedente).

Lorenzo comunque non molla la presa ed è sempre lì, ad un decimo, seguito dall'altro pilota Yamaha, Andrea Dovizioso, che su questa pista sembra trovarsi particolarmente a proprio agio in sella alla M1.

Bene anche Stefan Bradl che recupera qualche posizione in classifica guadagnando il quarto posto davanti a Valentino Rossi, anche lui risalito e adeso a quasi 6 decimi di ritardo dalla prima posizione.

In questo turno Ben Spies si è invece dovuto accontentare della sesta posizione seguito da Casey Stoner ed Alvaro bautista, con Cal Crutchlow in nona posizione e ultimo dei piloti racchiusi in meno di un secondo. Solo decimo, infine, Nicky Hayden, ad un secondo e mezzo di ritardo dal miglior crono di Pedrosa.

La classifica dei tempi:

01. Dani PEDROSA - Repsol Honda Team - 1'46"088
02. Jorge LORENZO - Yamaha Factory Racing - 1'46"190 - +0"102
03. Andrea DOVIZIOSO - Monster Yamaha Tech 3 - 1'46"282 - +0"194
04. Stefan BRADL - LCR Honda MotoGP - 1'46"428 - +0"340
05. Valentino ROSSI - Ducati Team - 1'46"687 - +0"599
06. Ben SPIES - Yamaha Factory Racing - 1'46"912 - +0"824
07. Casey STONER - Repsol Honda Team - 1'46"978 - +0"890
08. Alvaro BAUTISTA - San Carlo Honda Gresini - 1'46"983 - +0"895
09. Cal CRUTCHLOW - Monster Yamaha Tech 3 - 1'46"984 - +0"896
10. Nicky HAYDEN - Ducati Team - 1'47"592 - +1"504
11. Katsuyuki NAKASUGA - Yamaha YSP Racing Team - 1'47"801 - +1"713
12. Hector BARBERA - Pramac Racing Team - 1'48"232 - +2"144
13. Aleix ESPARGARO - Power Electronics Aspar - 1'48"470 - +2"382
14. Karel ABRAHAM - Cardion AB Motoracing - 1'48"757 - +2"669
15. Randy DE PUNIET - Power Electronics Aspar - 1'48"770 - +2"682
16. Colin EDWARDS - NGM Mobile Forward Racing - 1'49"539 - +3"451
17. James ELLISON - Paul Bird Motorsport - 1'49"652 - +3"564
18. Michele PIRRO - San Carlo Honda Gresini - 1'49"770 - +3"682
19. Roberto ROLFO - Speed Master - 1'50"292 - +4"204
20. Yonny HERNANDEZ - Avintia Blusens - 1'50"333 - +4"245
21. Ivan SILVA - Avintia Blusens - 1'50"924 - +4"836
22. Danilo PETRUCCI - Came IodaRacing Project - 1'51"270 - +5"182