Pedrosa si conferma il più veloce anche nelle qualifiche, conquistando la seconda pole position stagionale davanti al compagno di squadra Casey Stoner, che fino all'ultimo ha provato a beffare lo spagnolo mancando la prima posizione per soli 29 millesimi.

Nonostante una caduta nelle fasi iniziali, Pedrosa è riuscito a riprendere le prove stampando il suo giro più veloce in 2'01"462. Anche la terza Honda Repsol guidata da Andrea Dovizioso è riuscita a guadagnare la prima fila dello schieramento di partenza grazie al terzo posto dell'italiano che ha chiuso a due soli decimi dalla coppia in testa.

Il primo della seconda fila è invece il texano Colin Edwards, seguito da Marco Simoncelli e Nicky Hayden. Aoyama, Bautista e Rossi (caduto all'altezza della curva 9 nel primo quarto d'ora di prove) completano infine le prime nove posizioni seguiti dal secondo pilota Tech 3, Cal Crutchlow.

La classifica dei tempi:

01. Dani PEDROSA - Repsol Honda Team - 2'01"462
02. Casey STONER - Repsol Honda Team - 2'01"491 - +0"029
03. Andrea DOVIZIOSO - Repsol Honda Team - 2'01"666 - +0"204
04. Colin EDWARDS - Monster Yamaha Tech 3 - 2'02"010 - +0"548
05. Marco SIMONCELLI - San Carlo Honda Gresini - 2'02"105 - +0"643
06. Nicky HAYDEN - Ducati Team - 2'02"172 - +0"710
07. Hiroshi AOYAMA - San Carlo Honda Gresini - 2'02"254 - +0"792
08. Alvaro BAUTISTA - Rizla Suzuki MotoGP - 2'02"332 - +0"870
09. Valentino ROSSI - Ducati Team - 2'02"395 - +0"933
10. Cal CRUTCHLOW - Monster Yamaha Tech 3 - 2'02"756 - +1"294
11. Randy DE PUNIET - Pramac Racing Team - 2'02"939 - +1"477
12. Loris CAPIROSSI - Pramac Racing Team - 2'03"077 - +1"615
13. Karel ABRAHAM - Cardion AB Motoracing - 2'03"438 - +1"976
14. Hector BARBERA - Mapfre Aspar Team MotoGP - 2'03"619 - +2"157
15. Toni ELIAS - LCR Honda MotoGP - 2'03"646 - +2"184
16. Ben SPIES - Yamaha Factory Racing - 2'03"678 - +2"216
17. Katsuyuki NAKASUGA - Yamaha Factory Racing - 2'04"072 - +2"610